Le cas de figure est simple : on a un script du genre fancybox et une image. Comme vous ne le savez peut-être pas, ce genre de script redimensionne l'image si elle est trop grande par rapport à l'espace disponible pour que, par exemple, une image de 1024×1024px s'affiche entièrement sur un écran plus petit. Lors de l'affichage dans la fancybox l'image est redimensionnée et les coordonnées de l'imagemap ne correspondent plus à rien. Tout fout l'camp !